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学校坐落在国家历史文化名城徐州市南郊文化教育区，始建于1985年，隶属于江苏省药品监督管理局，原为江苏省徐州医药中等专业学校，1995年通过合格学校评估，2000年通过省级重点学校评估，2003年首批通过省教育厅高等学校设置评审委员会专家评估，升格为江苏省徐州医药高等职业学校，2005年被教育部批准为国家级重点职业学校，2010年被江苏省教育厅认定为省高水平示范职业学校，2015年被首批确定为江苏省高水平现代化职业学校，2017年被首批确定为江苏省现代化示范性职业学校，2018年被确定为江苏省职业学校“智慧校园”，2020年被确定为江苏省中等职业学校“领航计划”建设单位，承接教育部“提质培优三年行动计划”重要建设项目。学校是江苏省医药行业协会副会长单位，江苏联合职业技术学院医药专业建设指导委员会主任委员单位，中国医药教育协会职业技术教育委员会常务理事单位，全国药品职业教育教学指导委员会委员单位。